"USA mot Al-Arian" följer den muslimske familjen Al-Arian och deras desperata kamp för att rentvå sig från terroranklagelser igångsatt av amerikanska myndigheter. I februari 2003 blev universitetsprofessorn och palestinska aktivisten Sami Al-Arian arresterad i Tampa, Florida, anklagad för att ha stöttat en palestinsk terrororganisation. I 2 ½ år satt han fängslad på isolering i väntan på rättegång.
Filmen följer Sami, hans hustru Nahla och deras fem barn på nära håll genom den 6 månaders långa rättegången och en tid därefter. Det är ett mänskligt och personlig porträtt av en familj som i likhet med många andra muslimer, kämpar mot stigmatisering och diskriminering i USA efter den 11 september 2001. Filmen tar upp teman som yttrandefrihet, främlingsfientlighet och rätten till en rättvis rättegång. Det ger en chockande insyn i hur USAs fruktan och kamp mot terrorism kan sätta civila rättigheter i fara.
Den norska regissören Line Halvorsen presenterar demokrati i ett nytt ljus – i ett samhälle präglat av rädsla efter händelserna den 11 september.