Året är 2010 och tre barn, Rad, Carlos och Alexis, är på väg att återuppväcka kampen om universum mellan de goda Autoboterna och de onda Decepticonerna. De Minicons som bildar SkyBoom-skölden är försvunna och StarScream får genast skulden. Nu letar alla Autobots efter Minicons. När en komet närmar sig jorden ser Megatron sin chans att testa sitt nya vapen, Hydra-kanonen. Efter en lyckad testskjutning siktar Megatron mot ett nytt mål, nämligen jorden. Decepticons har riktat Hydra-kanonen rakt mot jorden och planerar för planetens undergång. För att rädda jorden beger sig Optimus och Jetfi re mot Decepticons rymdbas för att förstöra den. Nyheten att Optimus Prime är borta för alltid börjar sakta sjunka in hos de Autobots som överlevt. Hot Shot har svårast att acceptera det och bestämmer sig för att hämnas på Decepticons på egen hand. Autobots är nästan klara med det rymdskepp som ska ta dem till nästa strid på Cybertron mot Decepticons, som redan är på väg.