Datorexperten Walter O'Brien och hans udda team rekryteras av federalagent Cabe Gallo av US Department of Homeland Security för att bilda Scorpion som sägs vara den sista försvarslinjen mot komplexa, högteknologiska hot runt om i världen. I teamet ingår O'Brien, en av de mest intelligenta människor i världen med en IQ på 197, och hans vänner Sylvester Dodd, en "mänsklig miniräknare", Glad Quinn, ett "mekanisk underbarn", och Toby Curtis, en "psykolog av världsklass" (en Harvard-utbildad beteendevetare). Paige Dineen är en före detta servitris vars intuitiv interaktion med människor översätter den verkliga världen till laget, och de, i utbyte, hjälper att översätta och tolka hennes unga psykiskt begåvade son, Ralph, till henne.