I säsong 14 sker det stora förändringar för NCIS-agenterna. Specialagenten Leroy Jethro Gibbs och resten av insatsstyrkan fortsätter att lösa kriminalfall som rör USA:s marinkår. Två nya agenter ansluter sig till familjen: Nicholas Torres och Alexandra Quinn. MI6:s officer Clayton Reeves blir också en del av teamet. De här agenterna går dit bevisen leder dem för att upprätthålla USA:s säkerhet.