Jean, en ung uppfinnare deltar i en flygtävling vid världsutställningen i Paris 1899. Där träffar han Nadia, cirkusartist. Jean räddar henne från Grandis, en bandit, som skoningslöst förföljer Nadia för att stjäla Bluewater, en gåtfull ädelsten som hon bär runt sin hals. Efter en flykt befinner sig Jean och Nadia ombord på Nautilus, en mystisk ubåt under befäl av kapten Nemo. Han tar dem med på äventyr som de inte ens kunnat drömma om.
Fritt efter Jules Vernes ”En världsomsegling under havet”. Regi av Hideaki Anno. Karaktärer av Yoshiyuki Sadamoto. Maskindesign av Mahiro Maeda Animation av Group Tac och GAINAX ”Neon genesis evangelion”, ”FLCL”.
En mycket vackert animerad historia från några av de absolut bästa animeringsstudiorna i Japan.