Chaos, som lever på skräckslagna hjärtan, är till slut avslöjad som tyngden bakom Earl Tyrants kraft. Genom att förstöra och spotta ut världarna utanför för att strandsätta deras innevånare i det kaotiska landskapet Wonderland, växer sig Chaos allt starkare. Men inte ens den enorma energin som ges av att förgöra Fungus värld är nog för att fylla Chaos glupska buk.
Under tiden gör Omega ännu en attack på tunnelbanan. Fabula ingriper och räddar Lisa, Ai och Yu precis innan de skall slukas, bara för att lämpas av i ett ödelagt island.
Som tur är räddas de av Comodeen och de beslutar att slå sig samman för att stoppa spridningen av Chaos och återställa ordningen i Wonderland. De ger sig av i Cid's djuphavs-ubåt och finner sig snart fångade i Pist's dödliga havspussel, en labyrint. För varje kub i labyrinten de klarar kommer de närmre friheten, men för många fel tar dem raka vägen till botten där Chaos väntar.
Svaret kommer närmare för varje avsnitt i denna spännande episka resa. Följ gruppens färd mot hjärtat av detta märkliga land och hemligheten till dess frälsning... eller slutliga förgörelse!