Efter att ha avtjänat ett långt fängelsestraff är Jon fast besluten att lämna sitt kriminella förflutna bakom sig. Han vill börja plugga och få ett liv utan droger, våld och kriminalitet. Väl ute i friheten blir han snart medveten att även om han avtjänat sitt straff till staten så är det svårt att helt avskriva skulden till sin omgivning. Av lojalitet till sin yngre bror dras han sakta in i kriminalitetens värld igen samtidigt som han träffar sin stora kärlek Marlena.
”Blodsbröder” skildrar en verklighet som merparten i Sverige endast behöver uppleva på film. Likväl existerar den, sida vid sida med den vanliga svenska vardagen de flesta av oss tar för given. Vi fördömer och förfasar oss över människor som gått över gränsen då vi kanske istället borde försöka förlåta och förstå.