THE BROWN BUNNY är både en kärlekshistoria och ett skrämmande porträtt av en förlorad själ som inte kan glömma sitt förflutna.
Efter ett motorcykelrace i New Hampshire lastar Bud Clay (Vincent Gallo) in sin motorcykel bak i skåpbilen och ger sig av på en resa genom landet till Los Angeles, där han ska ställa upp i ett annat race. På sin resa möter han tre väldigt olika kvinnor: Violet – en frisk och sund, genomamerikansk tjej som jobbar på en bensinstation, Lilly (Cheryl Tiegs) – ytterligare en förlorad själ som han får kontakt med på en rastplats, och Rose – en prostituerad kvinna från Las Vegas.
Under resans gång kan Bud inte sluta tänka på sitt livs kärlek, Daisy (Chloe Sevigny), så han planerar att hälsa på henne när han kommer fram till Los Angeles.
När han kommer fram checkar han in på ett motell innan han besöker det övergivna hem som han tidigare delat med Daisy. Han lämnar en lapp och hoppas att hon ska söka upp honom på hans motellrum…
Filmen stegras mot ett välkänt klimax, ett ärligt porträtt av mannens sexualitet.